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ISOLATION AND CHARACTERIZATION OF ENDOPHYTES IN Eichhornia crassipes (Water hyacinth)

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Table of contents

 

CHAPTER ONE: Introduction                                                                                              1 

1.0       Background to the Study                                                                                           1 

1.2       Statement of Research Problems                                                                                4 

1.3       Justification of the Study                                                                                           4 

1.4       Aim of the Study                                                                                                        5 

1.5       Specific Objectives of the Study                                                                                5 

CHAPTER TWO                                                                                                                    6 

2.0       Literature Review                                                                                                       6 

2.1       Eichhornia crassipes                                                                                                   

2.2       Biology, Chemical Composition and Ecology of E. crassipes                                   

2.3       E. crassipes Impacts on Biodiversity Loss                                                                 11 

2.4       Economic impacts of E. crassipes                                                                              12 

2.5       Endophytic Microorganism                                                                                        13 

2.6       Endophytic Fungi                                                                                                       16 

2.7       Plant Colonization by Endophytic Fungi                                                                   17 

2.8       Relationship between Plant and Endophyte                                                               19 

CHAPTER THREE                                                                                                                22 

3.0       Materials and Methods                                                                                               22 

3.1       Collection of Samples                                                                                                 22 

3.2       Materials and Apparatus Used                                                                                   22 

3.3       Media Preparation                                                                                                       22 

3.4       Preparation of Eichhornia crassipes stem bark                                                           22 

3.5       Morphological Characterization                                                                                  23 

3.6       Biochemical Test                                                                                                         23 

3.6.1    Catalase Test                                                                                                               23 

3.6.2    Oxidase Test                                                                                                               24 

3.6.3    Indole Test                                                                                                                  24 

3.6.4    Urease Test                                                                                                                 24 

3.7       Lactophenol staining                                                                                                   25 

3.8       Examination of Antimicrobial Activities                                                                    25 

3.8.1    Agar Diffusion Assay                                                                                                 25 

CHAPTER FOUR                                                                                                                  26 

4.0       Results                                                                                                                        26 

CHAPTER FIVE: Discussion and Conclusion                                                                      32 

5.1       Discussion                                                                                                                   32 

5.2       Conclusion                                                                                                                  34 

References                                                                                                                              36 

 

 

 

 

 

 

 



 

LIST OF TABLES 

TABLES        TITLE                                                                                                PAGES 

4.1       Morphological and biochemical characterization of endophytic bacteria isolates      27 

4.2       Zone of inhibition of Endophytic bacteria against test organisms in (mm)                29 

4.3       Frequency and Percentage of Endophytic Bacteria in Eichhornia crassipes.            31 

Abstract

 

The aim of this study was to isolate and characterize endophytes in Eichhornia crassipes. Endophytic bacteria live in the interior of healthy plants without causing them any damage. These bacteria are of biotechnological interest; they may be used in the biological control of pests and plant diseases, and in the pharmaceutical industry. The aquatic macrophytes Eichhornia crassipes belong to the Pontederiaceae family.  Ten (10) isolates belonging to endophytic bacteria were isolated from the leave and stem of Eichhornia crassipes. The isolated endophitic bacteria were Pseudomonas aeruginosa (n=3), Bacillus species (n=4) and Micrococcus species (n=3). The zone of inhibition of the endophytic organisms isolated in this study on selected bacteria which include Staphylococcus spp. Diplobacilli, and Streptobacillus sp. showed Micrococcus species inhibit Staphylococcus sp. [A] (14.00mm) and Staphylococcus sp. B (12.00mm); Bacillus specie inhibit Staphylococcus sp. [A] (10.00mm), Streptobacilli [A] (10.00mm), Streptobacilli [B] (20.00mm), Staphylococus sp. [B] (12.00mm) and Streptobacilli [C] (10.00mm). Pseudomonas sp. inhibit Streptobacili sp. [A] (10.00), Streptobacilli sp. [B] (10.00) and Streptobacilli [c] (10.00mm). Studying the endophytic population is something important, due to it biotechnological application, because it has great potential against resistant pathogens. 

Keywords: Endophytes, Endophytic bacteria, Eichhornia crassipes, Aquatic macrophytes. 

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