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ISOLATION AND CHARACTERIZATION OF ENDOPHYTES IN Phyllanthus amarus

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Table of contents

 

CHAPTER ONE                                                                                                                     1 

1.1       Introduction                                                                                                                1 

1.2       Statement of Problem                                                                                                 4 

1.3       Justification of the Study                                                                                            5 

1.4       Aim of the Study                                                                                                        5 

1.5       Objectives of the Study                                                                                              5 

CHAPTER TWO: Literature Review                                                                                    6 

2.1       Description and Benefits of Phyllanthus amarus                                                       

2.1.1    Phytochemical constituents                                                                                        7 

2.1.3    Pharmacological studies                                                                                             9 

2.2       Endophytes Microbes                                                                                                 11 

2.2.1    Bacterial Endophytes                                                                                                  12 

2.2.2    Fungi Endophytes                                                                                                       15 

2.2.3    Relationship between plant and endophyte                                                                17 

CHAPTER THREE: Materials and Methods                                                                         19 

3.1       Collection and Identification of Samples                                                                   19 

3.2       Materials and Apparatus                                                                                             19 

3.3       Media Preparation                                                                                                      19 

3.4       Preparation of Phyllanthus amarus leaves                                                                 20 

3.5       Morphological Characterization                                                                                 24 

3.6       Biochemical Test                                                                                                        21 

3.6.1    Catalase Test                                                                                                               21 

3.6.2    Citrate Utilization Test                                                                                               21 

3.6.3    Oxidase test                                                                                                                                                                21 

3.6.4    Coagulase test                                                                                                             21 

3.7       Identification of endophytic fungi                                                                              22 

3.8       Tested Organisms                                                                                                       22 

3.8.      Examination of Antimicrobial Activities                                                                   22 

3.8.1    Agar Diffusion Assay                                                                                                 22 

CHAPTER FOUR: Results                                                                                                    24 

CHAPTER FIVE                                                                                                                    32 

5.1       Discussion                                                                                                                   32 

5.2       Conclusion                                                                                                                  35 

References                                                                                                                              37 

LIST OF TABLES 

Table                          Title                                                                                                    Pages 

1          Frequency and Percentage of Endophytic microorganisms (bacteria and 

            fungi) in Phyllanthus amarus Leaves.                                                                        27 

 

2          Morphological Characteristics of Endophytic Bacteria Isolated from    

            Phyllanthus amarus Leaves                                                                                        28 

 

3          Morphological Characteristics of Endophytic Fungi Isolated from 

Phyllanthus amarus Leaves                                                                                        29 

 

4          Biochemical Characteristics of the Endophytic Bacteria Isolated from   

            Phyllanthus amarus Leaves                                                                                        30 

 

5          Zone of Inhibition of Endophytic microorganism (bacteria and fungi) isolated             

            from Phyllanthus amarus Leaves on tests organisms                                    31 

LIST OF FIGURE 

Figure              Title                                                                                                    Page 

2.1       Phyllanthus amarus                                                                                       

4.1       Percentage of Antagonistic Activities of Endophytic bacteria and Fungi 

            on Phyllanthus amarus on tests organisms.                                                   32 

Abstract

 

Endophytes are microorganisms that live inside the host plant tissues which have novel metabolites exhibiting a variety of biological activities against different pathogens. This study was carried out to examine the antimicrobial properties of endophytes of Phyllanthus amarus on selected pathogenic bacteria. Seventeen (17) endophytic bacteria and fungi were isolated from the leave of Phyllanthus amarus. The isolated endophytic bacteria were Pseudomonas spp. (n=3), Staphylococcus aereus (n=3), Klebsiella spp. (n=3) and Bacillus spp. (n=2).The isolated endophictic fungi were Aspergillus niger (n=1), Penicillum roqueforti (n-1), Fusarium oxysporus (n=1), Aspergillus flavus (n=1), Aspergillus fumigatus (n=1) and Aspergillus clavatus (n=1). Bacillus sp. exhibited higher activity against the tests organisms (100%), followed by Fusarium oxysporum (60%), Apsergillus clavatus (60%), Aspergillus niger (60%), Aspergillus fumigatus (40%), Staphylococcus aureus (40%) and Pseudomonas sp. (40%), Penicillum roqueforti (40%) and Klebsiella spp. (20%).  Studying the endophytic population is something important due to it biotechnological application, because it has great potential against resistant pathogens. 

 

Keywords: Phyllanthus amarus, Antimicrobial, Endophytes, Pathogenic bacteria 

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